K zásadní změně v dosavadním politickém vývoji země, k mocensko politickému zvratu, který mnozí politici a historici nazvali "sametovou revolucí", došlo v listopadu 1989. Tehdy, i pod nemalým vlivem událostí v sousedních zemích, došlo k širokému masovému vystoupení občanů a mládeže proti dosavadní politické moci, reprezentované prostřednictvím Národní fronty Komu-nistickou stranou Československa. Nově vzniklé "Občanské forum", vytvořené již 19. listopadu v pražském Činoherním klubu a složené ze zástupců různých občanských iniciativ v čele s Václavem Havlem, začalo, podporováno množstvím lidí v ulicích a na náměstích, jednat s představiteli stávajícího režimu o předání politické moci tak, aby se předešlo možným násilnostem či krvavým střetům. Počátkem prosince odstoupil dosavadní prezident Gustav Husák a 29.12. byl zvolen prezidentem Václav Havel. Politické vítězství opozice i politická prohra komunistické strany byly jednoznačné.
V Merklíně bylo Občanské forum založeno 24.11.1989. V prosinci byla dvě veřejná shromáždění občanů v sále místní sokolovny, kde se občané vyjadřovali k programu OF. Zároveň byla požadována změna ve složení poslanců MNV, odpovídající změně politické situace. Od 1.3.1990 odešlo 6 volených poslanců a doplněno 6 zástupci dle návrhu OF. Dne 9.6.1990 proběhly parlamentní volby, voleb se zúčastnilo 666 z 686 zapsaných voličů. Výsledky ukázaly, že nejvíce hlasů v naší obci obdrželo OF, po něm KSČ a strana zemědělská.
Dne 24.11.1990 proběhly dle zákonných úprav volby do obecních zastupitelstev. Do komunálních voleb kandidovaly strany (OF, KSČ, Československá strana zemědělská), Sdružení nezávislých kandidátů a jeden nezávislý kandidát. Zvoleno bylo 15 členů nového zastupitelstva obce, a to za: OF - 5 členů, Sdružení nezávislých - 5, KSČ - 4, Strana zemědělská - 1. Starostou zvolen Josef Liška (nezávislý), místostarostou Adolf Vydra (KSČ). V tomto volebním období došlo k podstatným změnám v oblasti majetkoprávních vztahů s ohledem na privatizaci a restituční zákon. Po ukončení činnosti OPS Přeštice byla jeho činnost v Merklíně nahrazena soukromými provozovnami. Stejně tak v oblasti obchodu a ostatních služeb. V listopadu 1992 zemřel Adolf Vydra, místostarosta obce a jeho funkci převzal ing. Jan Nozar.
Ve volebním období provedeno:
Dne 18. a 19.11.1994 proběhly volby do obecního zastupitelstva. Byla pouze jedna kandidátní listina "Sdružení nezávislých kandidátů" s třinácti kandidáty. To ovlivnilo volební účast a z 821 zapsaných voličů hlasovalo pouze 380 voličů, tj. 46 %. Bylo zvoleno 13 členné zastupitelstvo. Starostou zvolen Václav Mikuláš, místostarostou Václav Švejda.
Dne 13. a 14.11.1998 proběhly volby do obecního zastupitelstva. Byla opět pouze jedna kandidátní listina "SNK" s patnácti kandidáty. Voleb se zúčastnilo 253 občanů ze 708 zapsaných voličů, tj. 35,7 %. Bylo zvoleno patnáctičlenné zastupitelstvo obce (12 z Merklína, 3 z Kloušova). Starostou zvolen Václav Švejda, místostarostou Antonín Tomíšek. Po dlouhotrvajících deštích byla v srpnu 2002 ČR zasažena povodněmi. Dne 7.8. byl vyhlášen 3. stupeň povodňové aktivity i na Merklínce. Situace se postupně zhoršovala. 12.8. dochází ke smetení provizorního koryta na hrázi a přitékající zvětšený proud vody postupně narušuje komunikaci. 13.8. se protrhla hráz rybníka Kačerna a dochází ke zvýšení hladiny vody v Kloušově, k zatopení luk a sklepů. Byla provedena částečná evakuace obyvatelstva z ohrožených lokalit. Došlo ke značným škodám na rod. domech především v ulicích: U Jezera, Arbesova, Na Písku, u mostu v Sokolské a v Kloušově u Merklínky. Povodně způsobily nesplnění plánu termínu plynofikace a došlo k potížím při zajištění předčasného termínu užívání. Konečné úpravy místních komunikací byly provedeny až v r. 2003, kolaudace v dubnu.
- plynofikace obce v rámci "Sdružení obcí".
Z ostatních akcí: